FynBus har flextrafik-kontrakter for i alt 40 mio. kr. med selskaber ejet af Hussein Salem Al-Badri, der er idømt 13 års fængsel for narkosmugling. FynBus undersøger muligheden for at opsige kontrakterne, men melder, at lovgivning og myndighedsarbejde kommer til kort. Fagforeninger kræver, at de offentligt finansierede kørsler stoppes.
I 2026 afdækkes en omfattende sag om tre brødre med kriminel baggrund, der gennem flere selskaber har haft flextrafik-kontrakter for hundredvis af millioner kroner hos FynBus, Sydtrafik og Midttrafik. Forløbet spænder fra narkodom og konkurser over revisorforbehold til, at selskabet Reliable mister alle køretilladelser, og rejser spørgsmål om kontrol med offentlige udbud.