Novafos' bestyrelse drøftede i september 2018 investeringsplaner på 843 mio. kr. i 2018 og samlet 3,4 mia. kr. for 2019-2022. Samtidig blev anlægsomkostningerne til Harrestrup Å-projektet anslået reduceret fra 2,2 mia. kr. til 1,1 mia. kr.
Novafos har over flere år planlagt og vedtaget store investeringer i kloakseparering, klimatilpasning og nye rensningsanlæg – bl.a. 3,4 mia. kr. i 2019-2022 og Gladsaxes spildevandsplan på 1,8 mia. kr. Investeringerne finansieres over taksterne, hvilket i 2026 fører til markante takststigninger i Frederikssund.