EU-Kommissionen godkender i marts 2020 en ændret finansieringsmodel og statsstøtte til Femern Bælt-forbindelsen efter en årelang strid med Scandlines og Stena Line. Modellen bygger på statsgaranti og statslige genudlån, og der fastsættes et loft på 69,3 mia. kr. for sådanne lån og genudlån. Femern A/S' finansielle analyse angiver en tilbagebetalingstid på 28 år efter åbningen.
Fra Scandlines' første retlige angreb på statens Femern-analyser og statsstøtte over EU's godkendelse af en ny finansieringsmodel i 2020 til de store forsinkelser og fordyrelser, der i 2026 har bragt den samlede anlægsregning over 100 mia. kr.